
Universidade Federal de Santa catarina (UFSC)
Programa de Pós-graduação em Engenharia, Gestão e Mídia do Conhecimento (PPGEGC)
Detalhes do Documento Analisado
Centro: Ciências Biológicas
Departamento: Biologia Celular, Embriologia e Genética/BEG
Dimensão Institucional: Pesquisa
Dimensão ODS: Social
Tipo do Documento: Projeto de Pesquisa
Título: PERFIL DO MICROBIOMA INTESTINAL HUMANO COM DADOS DE METAGENOMA EM BRASILEIROS.
Coordenador
- ILIADA RAINHA DE SOUZA
Participante
- ILIADA RAINHA DE SOUZA (D)
- JEANINE SCHÜTZ CARDOSO TEÓFILO
- LIA KUBELKA DE CARLOS BACK
Conteúdo
O microbioma humano engloba o complemento total...o microbioma humano engloba o complemento total de genes microbianos, produtos gênicos e genomas da microbiota (todo o habitat, incluindo os microrganismos bactérias, archaea, vírus bacteriófagos e microrganismos eucariotos) que habitam o corpo humano. estima-se que os microrganismos que vivem nos humanos superam em número as células somáticas e germinativas humanas em um fator de dez. juntos, os genomas desses simbiontes microbianos fornecem características que os humanos não precisaram evoluir sozinhos. a maioria dos 10 a 100 trilhões de microrganismos no trato gastrintestinal humano vive no cólon. mais de 90% de todos os tipos filogenéticos (filotipos) das bactérias do cólon pertencem a apenas 2 das 70 divisões conhecidas (filo) no domínio bacteria: as firmicutes e as bacteroidetes. a maioria dos estudos da microbiota intestinal atualmente se concentra em bactérias e essencialmente ignora outros microrganismos presentes, mas existe terminologia para descrever os estudos com as outras formas. uma das questões fundamentais na pesquisa do microbioma é a caracterização da microbiota humana saudável. estudos apontam divergências substanciais na estrutura do microbioma entre indivíduos saudáveis de diferentes etnias, idades e regiões geográficas. outra questão observada é a notável diversidade dos microrganismos que ocupam habitats como o intestino, a pele e a vagina. grande parte dessa diferença permanece inexplicada, embora a dieta, o ambiente, a genética do hospedeiro e a exposição microbiana precoce tenham sido implicados. esforços internacionais tem sido realizados no sentido de elucidar os papéis desempenhados pela microbiota, entretanto quando avaliado o mapa do microbioma internacional disponível, o brasil não está representado. justificativa: a pequena quantidade de estudos da composição do microbioma intestinal humano na população brasileira e em especial pela metodologia de sequenciamento por “whole genome sequencing shotgun” (wgs-shotgun) frente aos avanços do assunto em nível mundial põe urgência nas pesquisas sobre o tema, cada vez mais relevante em todos os âmbitos da área da saúde. objetivos: com este projeto pretende-se verificar e entender a diversidade do microbioma intestinal humano na população brasileira a partir de dados amostrais já coletadas e analisadas através da identificação genômica utilizando tecnologia de whole genome sequencing shotgun (wgs-shotgun). e ainda estabelecer possíveis relações entre o microbioma e alguns parâmetros, como idade, sexo, imc, estados de saúde/doença ou fatores ambientais, cruzando as análises com dados coletados em questionário já realizado. material e métodos: este trabalho se desenvolverá através de dados obtidos pelo laboratório biogenetika. os indivíduos amostrados para este trabalho, voluntários, foram esclarecidos quanto a possibilidade de uso de seus dados para a pesquisa e assegurados do sigilo das informações pessoais (termo de confiabilidade e sigilo), assinando na sequência o termo de consentimento livre esclarecido elaborado e mantido pela lab. biogenetika. serão analisados os resultados disponibilizados pelo lab. que realizou previamente a coleta das amostras de fezes, o processamento das amostras para leitura do genoma e que enviou pela plataforma one codex® as leituras dos genomas obtidos para análise. os indivíduos participantes do estudo não foram padronizados, sendo que os mesmos procuraram o lab. biogenétika de forma voluntária para realizar seu teste de microbioma individual, e assinatura de uma carta de sigilo e confidencialidade dos dados por parte do laboratório. este estudo compreende indivíduos saudáveis ou com alguma condição de saúde específica que serão descritos e considerados durante o desenvolvimento deste projeto. no momento do cadastro para a coleta das amostras foi realizado um questionário, já padronizado pelo lab. biogenétika, onde todos os participantes precisaram informar os seguintes dados: idade, sexo, profissão, peso, altura, tipos de dieta (com recordatório de 24h), consumo ou não de bebidas alcoólicas, se possuem vícios, se fazem uso de medicamentos, se fazem uso de suplementos, se utilizam probióticos, se realizaram ou não tratamento de quimioterapia, se praticam alguma atividade física e o tipo de nascimento (parto normal ou cesariana). a técnica de coleta utilizada no projeto foi através de amostras fecais, devido a sua conveniência para amostras de microbiota intestinal e, muitas vezes, por fornecer oportunidades para estudos longitudinais e em larga escala. ele tem sido considerado como um substituto aceitável para a microbiota intestinal distal, em parte devido à sua natureza de coleção não invasiva. as coletas de amostras de fezes iniciaram em abril de 2018 e se estenderam até agosto de 2020. foram obtidos dados do microbioma de 110 indivíduos. os participantes receberam um kit para coleta de fezes (omnigene.gut da marca dna genotek) com as instruções de coleta. as amostras com cerca de 520 mg de fezes foram mantidas em temperaturas de 15 a 25 graus celsius por até 60 dias. o sequenciamento do material genético da microbiota presente, capturada a partir das amostras de fezes, foi realizado em laboratório específico e próprio para tal, através da técnica de “shotgun” de genomas em nexseq500 (illumina). as sequências obtidas por sequenciamento “shotgun” foram analisadas através da plataforma one codex®, onde foram verificados os níveis e estimativas de abundância em nível de filo até espécies e cepas, dos diferentes organismos encontrados. também é avaliado o índice de diversidade. a análise taxonômica será apresentada em forma de um quadro taxonômico com as leituras em nível de filo até espécies. resultados esperados: os resultados esperados com este trabalho são o entendimento da composição e diversidade de metagenomas e o estabelecimento de padrões metagenômicos associados a características clínicas e epidemiológicas na população brasileira, além disso, contribuirá para a formação de profissional pós-graduado. viabilidade: este projeto possui uma alta viabilidade por existir dados de um número amostral considerado de indivíduos e profissional capacitado para a realização destas metodologias inovadoras.
Índice de Shannon: 3.83517
Índice de Gini: 0.922279
ODS 1 | ODS 2 | ODS 3 | ODS 4 | ODS 5 | ODS 6 | ODS 7 | ODS 8 | ODS 9 | ODS 10 | ODS 11 | ODS 12 | ODS 13 | ODS 14 | ODS 15 | ODS 16 |
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ODS Predominates


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