Esta tese elabora, sob um paradigma sistêmico, o argumento para a utilização de um modelo baseados em culturas celulares e de tecidos vegetais como alternativa de detecção de efeitos não- intencionais da transformação genética de plantas. a avaliação de efeitos não-intencionais em culturas de células ou tecidos vegetais in vitro possui vantagens em comparação a plantas inteiras, quais sejam: i) utilização de um modelo de menor complexidade que o sistema real (planta), facilitando e agilizado processos e possibilitando insights sistêmicos, ii) alto controle ambiental de ajuste fino, viabilizando comparações fidedignas entre plantas transgênicas e suas contrapartes convencionais, iii) alta resolução de efeitos não-intencionais em processos ontogenéticos e morfogenéticos iv) altas taxas de crescimento/proliferação, e v) aplicabilidade para experimentação. o modelo conceitual/interativo estabelecido neste estudo evidenciou respostas ontogenéticas e morfogenéticas diferencias entre o híbrido transgênico e o híbrido convencional utilizados como dupla quase-isogênica modelo. o mapeamento do perfil protéico de culturas de milho gm e nm permitiu elucidar e relacionar múltiplos processos biológicos afetados pela regulação diferencial de proteínas, incluindo metabolismo de carboidratos e energia, metabolismo de proteínas e outras macromoléculas, respostas a stress e a estímulos, metabolismo de fitorreguladores, entre outros. especula-se que as diferenças observadas mostrem-se menores em plantas cultivadas no campo, uma vez que o modelo conceitual consiste duma simplificação do sistema real, onde as variáveis ambientais são finamente controladas, assim permitindo uma alta resolução de efeitos não-intencionais da transformação genética.