Introdução: sepse é definida como a presença de disfunção orgânica ameaçadora à vida em decorrência da presença de uma resposta desregulada do organismo à infecção. durante a sepse, o sistema nervoso central é um dos primeiros órgãos afetados, e isso pode apresentar-se clinicamente como delirium e encefalopatias em graus que podem ser leves ou até mesmo coma e morte. a presença de autoanticorpos contra a superfície das células neuronais ou proteínas sinápticas é objeto de atenção em estudos nos últimos anos. alvo de estudo nos últimos anos, os autoanticorpos a proteínas neuronais foram encontrados em diferentes condições patológicas. objetivo: determinar a presença de diferentes autoanticorpos contra a superfície das células neuronais ou proteínas sinápticas no soro de pacientes sépticos e sua relação com a ocorrência de disfunção cerebral. método: estudo quantitativo transversal com coleta de dados entre agosto de 2015 e maio de 2016, amostra coletada por conveniência de pacientes adultos admitidos em quatro utis. resultados: 75% (n=45) dos pacientes incluídos apresentava choque séptico e o foco de infecção foi predominantemente pulmonar 59% (n=35). quanto a disfunção cerebral 68% (n=41) dos pacientes incluídos foram acometidos, a mortalidade geral durante a internação na uti foi de 28% (n=17). a positividade dos auto-anticorpos foi entre 18 e 25% dependendo da proteína avaliada. não houve associação significativa entre positividade de autoanticorpos e mortalidade na uti. conclusão: a associação entre disfunção cerebral e autoanticorpos não é clara, com a presença de autoanticorpos em pacientes com disfunção cerebral e sépticos. dos seis auto-anticorpos contra a superfície celular neuronal ou proteínas sinápticas medidas a positividade foi entre 18 e 25% em pacientes críticos com sepse. anti-gababr foi associado de forma independente à ocorrência de delírio e auto-anticorpos anti-lgi1 e anti-caspr2 foram independentemente da mortalidade hospitalar.