
Universidade Federal de Santa catarina (UFSC)
Programa de Pós-graduação em Engenharia, Gestão e Mídia do Conhecimento (PPGEGC)
Detalhes do Documento Analisado
Centro: Não Informado
Departamento: Não Informado
Dimensão Institucional: Pós-Graduação
Dimensão ODS: Ambiental
Tipo do Documento: Tese
Título: BIONANOCELLULOSE: NEW METHODS FOR BIOFILM PRODUCTION AND HIGH-QUALITY BACTERIAL RNA EXTRACTION
Orientador
- LUISMAR MARQUES PORTO
Aluno
- SAMARA SILVA DE SOUZA
Conteúdo
A bionanocelulose, também conhecida como nanocelulose bacteriana (bnc), tornou-se um importante biomaterial para aplicações industriais, tecnológicas e biomédicas. komagataeibacter hansenii atcc 23769 produz um biofilme de bnc microestruturado e organizado em nanofibras. apesar de sua relevância biotecnológica, e o fato de que os avanços das técnicas de ômicas e tecnologias de próxima geração abriram uma nova era no estudo dos sistemas biológicos, este organismo não foi investigado à nível molecular e nem a montagem do transcriptoma nem o modelo metabólico em escala genômica de k. hansenii foi esclarecido. neste estudo, abordamos especificamente os gargalos do estado atual do i) transcriptoma e ii) aplicações metabólicas em estudos de produção de biofilme de nanocelulose. os principais desafios associados a esses gaps são: i) a dificuldade de obter rna de alta qualidade de células de bactérias em biofilmes de nanocelulose devido a grande quantidade de polissacarídeos e fibras e ii) a necessidade de obter medidas metabólicas precisas, o que é um problema quando um meio de cultura complexo é usado no processo. primeiro, desenvolvemos um método de extração otimizado para obter rna de alta qualidade de células de k. hansenii que vivem / produzem biofilmes de bnc. o método é baseado em diferentes técnicas de ruptura celular em combinação com reagentes de extração de rna. para o isolamento bem-sucedido de rna intacto, foi realizado um tratamento de dnase eficiente para remover dna genômico e garantir amostras de rna puro. o método foi avaliado pela qualidade, quantidade e integridade das amostras de rna e é o primeiro a permitir o isolamento de rna altamente concentrado e intacto de células de k. hansenii em biofilmes e em estado planctônico. o método de extração de rna desenvolvido que produz consistentemente amostras de rna de alta qualidade agora pode ser usado para sequenciamento, permitindo a análise da expressão gênica e, consequentemente, melhorando a compreensão da síntese de bnc. o segundo problema que abordamos no presente estudo foi o desenvolvimento de um meio de cultura mínimo definido (dmcm) para a produção de bnc. o meio de cultura mais comum usado para produzir bnc é um meio complexo que contém extrato de levedura e peptona, portanto, possui composição química indefinida. o meio dmcm desenvolvido é composto por sete componentes, fosfato dissódico, fosfato monopotássico, cloreto de sódio, sulfato de magnésio, cloreto de cálcio, cloreto de amônio como fonte de nitrogênio e glicose como fonte de carbono. diferentes fontes de carbono e nitrogênio foram testadas, variando suas concentrações, e os resultados revelaram 25 mm de glicose e 10 mm de nh4cl como as melhores concentrações e fontes de carbono e nitrogênio. além disso, o meio de cultura dmcm desenvolvido agora pode ser utilizado para obter dados experimentais para apoiar futuras pesquisas metabólicas in silico para uma melhor compreensão da produção de bionanocelulose, identificando as capacidades metabólicas e o comportamento da bactéria em termos de crescimento, demanda de nutrientes e geração de metabólitos extracelulares. além disso, as membranas sintetizadas em dmcm mostraram uma transparência previamente desconhecida, que não foi relatada sem a adição de outras substâncias. a caracterização das membranas bncmínimo revelou melhorias importantes em algumas propriedades, como maior capacidade de retenção de água, superfície altamente porosa e melhor elasticidade do que as membranas usuais. assim, o meio de cultura definido proposto aqui pode ser explorado para sintetizar membranas de bionanocelulose transparentes com propriedades únicas de interesse considerável para várias aplicações nos campos biomédico e industrial. em resumo, este estudo desenvolveu novos métodos para a extração de rna bacteriano de alta qualidade e para a produção de biofilmes que permitirão o uso em análises transcriptômicas e metabolômicas para a compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na biossíntese bnc. o método de extração de rna otimizado foi desenvolvido para produzir amostras de rna com quantidade, pureza e integridade das células de k. hansenii que vivem / produzem biofilmes de bnc. a partir de amostras de rna de alta qualidade de k. hansenii em biofilmes e em estado planctônico, a montagem do transcriptoma poderá ser realizada para identificar genes alvo que têm um alto impacto na síntese de bnc. em relação ao meio de cultura mínimo definido desenvolvido, esse estudo comprovou a capacidade de k. hansenii em sintetizar bnc com limitação de nutrientes. dmcm pode fornecer análises metabólicas precisas e maior reprodutibilidade experimental em comparação com meios complexos.
Índice de Shannon: 3.91557
Índice de Gini: 0.930179
ODS 1 | ODS 2 | ODS 3 | ODS 4 | ODS 5 | ODS 6 | ODS 7 | ODS 8 | ODS 9 | ODS 10 | ODS 11 | ODS 12 | ODS 13 | ODS 14 | ODS 15 | ODS 16 |
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3,35% | 6,81% | 5,63% | 5,51% | 3,64% | 9,96% | 8,74% | 5,55% | 9,60% | 3,43% | 7,17% | 9,12% | 4,47% | 7,00% | 4,21% | 5,81% |
ODS Predominates


3,35%

6,81%

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9,96%

8,74%

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