O tomate (solanum lycopersicum l.) é um dos produtos hortícolas mais consumidos no mundo, seja na forma processada ou in natura. no brasil, doenças foliares como a mancha bacteriana causada por xanthomonas gardneri (xg) e a pinta bacteriana causada por pseudomonas syringae pv. tomato (pst) são comuns e acarretam inúmeras perdas econômicas na produção de tomate. a crescente preocupação com saúde humana e ambiental tem incentivado diversas pesquisas em prol de uma agricultura mais sustentável. estudos recentes têm demonstrado a potencialidade de uma vasta gama de micro-organismos endofíticos isolados a partir de diversas espécies vegetais para o controle de fitopatógenos. neste contexto, o objetivo deste trabalho foi isolar bactérias a partir de diferentes genótipos de tomate e selecionar isolados para o controle biológico da mancha e da pinta bacteriana. para isto, realizou-se o isolamento de 119 isolados bacterianos a partir de amostras de parte aérea, semente e raízes de 15 cultivares de tomate. informações sobre a origem das amostras e características morfo-fisiológicas, dentre elas a morfologia de colônia, teste gram, produção de pigmentos fluorescentes, amilase e pectinase, permitiram distinguir 34 isolados endofíticos. para acessar o potencial dos mesmos no controle de doenças foliares do tomateiro, realizou-se uma seleção prévia com auxílio de metodologias in vitro contra os patógenos xg e pst. na sequência avaliou-se por meio de ensaios em condições de casa de vegetação o efeito dos isolados na redução da severidade da mancha bacteriana causada por xg. ao todo, 24 isolados (70,54%) foram capazes de produzir sideróforos em meio cromo azurol s e 17 (50%) foram caracterizados como positivos para capacidade de solubilizar fosfato bicálcico. onze isolados bacterianos inibiram o crescimento de xg e três destes também apresentaram atividade antimicrobiana frente a pst. as bactérias endofíticas selecionadas, isolados iso043, iso057, iso137 e isso125 reduziram a severidade da mancha bacteriana causada por x. gardneri em condições de casa de vegetação, em 2 experimentos independentes. apenas o isolado iso123 não diferiu da testemunha na avaliação feita aos 21 dias após a inoculação do patógeno, no 2º experimento. após comparar o perfil de dna dos isolados iso043 e iso137 gerado pela técnica de box-pcr, verificou-se que estes correspondem à mesma espécie do gênero pseudomonas e provavelmente à mesma linhagem de bactéria. apesar do nível de controle da bacteriose não diferir significativamente para os quatro isolados endofíticos promissores, os isolados iso043 e iso137 apresentam vantagens pois, esta linhagem de bactéria pode colonizar tanto a parte aérea quanto a parte radicular do tomateiro. além disso, esta linhagem é capaz de produzir sideróforos e solubilizar fosfatos inorgânicos. mais estudos são necessários para verificar a eficácia da aplicação dos isolados obtidos neste trabalho em condições de campo e também a eficácia in vivo contra p. syringae pv. tomato. entretanto, a possibilidade de uso destas bactérias é uma alternativa promissora para o controle de bacterioses foliares. isto por que além da ação direta de compostos antimicrobianos, os endofíticos poderiam proporcionar um controle indireto de doenças vegetais devido à melhora nas condições nutricionais da planta.