Este estudo teve como objetivo analisar a atividade física, aptidão aeróbica e o risco de doença cardiovascular de crianças e adolescentes que vivem com o vírus da imunodeficiência humana (hiv) e um grupo de controles (sem diagnóstico de hiv). a pesquisa, do tipo transversal, foi desenvolvida de novembro/2015 a setembro/2016 em florianópolis, brasil. a amostra foi composta por 130 crianças e adolescentes (53,8% meninas) de oito a 15 anos, divididas em grupo hiv (n = 65) e controle (n = 65). a atividade física de intensidade moderada à vigorosa (afmv) foi mensurada por acelerômetros por, no mínimo, quatro dias. a aptidão aeróbica foi expressa pelo consumo pico de oxigênio (vo2 pico), que foi mensurado pela análise da troca de gases expirados em teste incremental máximo em cicloergômetro. o risco de doença cardiovascular foi caracterizado pela medida da gordura corporal total e do tronco, pressão arterial, colesterol total e frações hdl-c e ldl-c, triglicerídeos, glicose, insulina, proteína c-reativa (pcr), interleucina (il)-6, fator de necrose tumoral-alfa (tnf-¿) e espessura médio-intimal carotídea (emic). participantes do grupo hiv demonstraram menor vo2 pico (39,2 vs. 44,5 ml.kg-1.min-1) e blocos contínuos de cinco (19,7 vs. 26,6) e 10 minutos (3,6 vs. 5,8) de afmv comparados ao grupo controle. participantes do grupo hiv sem uso de terapia antirretroviral demonstraram menor vo2 pico (¿ = -8,529). o grupo hiv quando comparado ao controle demonstrou maior concentração de glicose (87,9 vs. 75,9 mg.dl-1), ldl-c (94,7 vs. 79,5 mg.dl-1), triglicerídeos (101,2 vs. 61,6 mg.dl-1), pcr (1,6 vs. 1,0 mg.l-1), il-6 (1,42 vs. 0,01 pg.ml-1), tnf-¿ (0,49 vs. 0,01 pg.ml-1) e emic (0,526 vs. 0,490 mm) e menor hdl-c (53,7 vs. 69,4 mg.dl-1). as alterações clínicas mais significativas foram associadas aos participantes com hiv em uso de inibidores de protease na terapia antirretroviral, como o maior homa-ir (¿ = 0,359), colesterol total (¿ = 18,428), ldl-c (¿ = 22,352), triglicerídeos (¿ = 0,679), pcr (¿ = 0,354) e emic (¿ = 0,056). porém, independente do uso de terapia antirretroviral, crianças e adolescentes que vivem com hiv demonstraram maior il-6 e menor hdl-c comparado aos controles. verificou-se no grupo hiv que os maiores níveis de afmv foram inversamente associados à gordura corporal total (¿ = -3,566), do tronco (¿ = -3,495), colesterol total (¿ = -0,112) e ldl-c (¿ = -0,830). similarmente, o maior vo2 pico foi associado à menor gordura corporal total (¿ = 0,629), do tronco (¿ = 0,592) e pcr (¿ = -0,059). participantes que vivem com hiv e “fisicamente ativos” demonstraram menores valores de colesterol total e ldl-c (-24,4 e -20,1 mg.dl-1, respectivamente) comparado aos pares “insuficientemente ativos”. assim como participantes com hiv e “aptidão aeróbica satisfatória” mostraram menor gordura corporal total e do tronco (-4,1 e 4,3%, respectivamente) e menor concentração de pcr (-2,3 mg.l-1), il-6 (-2,4 pg.ml-1), tnf-¿ (-1,0 pg.ml-1) comparado aos pares com “baixa aptidão aeróbica”. conclui-se que: 1) aptidão aeróbica e blocos de afmv estão reduzidos em crianças e adolescentes que vivem com hiv comparado aos controles; 2) inflamação crônica de baixo grau, dislipidemia, resistência à insulina e maior emic representam maior risco de doença cardiovascular crianças e adolescentes que vivem com hiv; 3) níveis elevados de afmv e aptidão aeróbia foram associados à menor concentração de lipoproteínas e de mediadores de inflamação crônica de baixo grau, respectivamente, e simultaneamente associados aos menores valores de gordura corporal. as associações encontradas sugerem um potencial da atividade física com intensidade suficiente para aprimorar a aptidão aeróbica em mitigar o risco cardiovascular em crianças e adolescentes vivendo com hiv.