No exercício profissional, militares são expostos a diferentes fatores de adoecimento. o objetivo geral deste trabalho foi analisar o perfil epidemiológico e sócio-ocupacional de policiais e bombeiros militares de santa catarina afastados do trabalho para tratamento de saúde no período de 2013 a 2016. foram analisados 5777 afastamentos ocorridos neste período. trata-se de uma pesquisa de delineamento epidemiológico, descritivo, com corte transversal e de abordagem quantitativa. os agravos à saúde mais prevalentes entre a população estudada foram: s00-t98: lesões, envenenamentos e algumas outras consequências de causas externas (11,44%); m00-m99: doenças do sistema osteomuscular e do tecido conjuntivo (10,25%) e f00-f99: transtornos mentais e comportamentais (6,32%). entre militares de santa catarina afastados por tmc predominam características como ser policial militar, do sexo masculino, são da carreira praças, atuantes tanto em atividades operacionais quanto administrativas. os transtornos neuróticos, transtornos relacionados com estresse e transtorno somatoformes (f40-f48) e transtornos de humor (f30-f39) foram os mais prevalentes na população estudada, responsáveis por 67,4% dos afastamentos por tmc. transtornos mentais e comportamentais devidos ao uso de substância psicoativa (f10-f19) apresentam prevalência de 0,5% dos afastamentos por tmc, e transtorno de personalidade e do comportamento adulto (f60-f69) 0,22%. o adoecimento dos militares está relacionado com o processo laboral e ter clareza dessa relação permite reorganizar contingências mais favoráveis ao processo de trabalho e modificá-lo em razão da manutenção da saúde desses profissionais. a criação de um banco de dados multidisciplinar e permanente sobre os afastamentos permitiria acompanhar a evolução do adoecimento dos militares em santa catarina. futuras investigações poderiam explorar as variáveis não analisadas, especialmente sobre as condições associadas aos diagnósticos e situações psicossociais que culminaram no adoecimento.