O consumo de ostras pode ser responsável pela veiculação de doenças para humanos, pois estes animais podem acumular substâncias tóxicas e microrganismos patogênicos em seus tecidos. vírus entéricos humanos podem apresentar padrões distintos de acumulação nas ostras, dificultando que sejam removidos durante a depuração. estudos da cinética de decaimento de contaminantes microbiológicos e químicos nas ostras, durante a depuração, são escassos. o objetivo desse trabalho foi estudar a dinâmica de aquisição e eliminação de contaminantes químicos e microbiológicos, no meio ambiente e durante os processos de depuração. esta pesquisa abrangeu duas etapas distintas, envolvendo a alocação de ostras por 14 dias em quatro locais na baía de florianópolis-sc: dois liberados ao cultivo (rib-ribeirão da ilha e sal-santo antônio de lisboa) e dois impróprios (tap-tapera e buc-estuário do rio bücheler). na primeira etapa (capítulo i) foi medida a contaminação ambiental destes locais e na segunda (capítulo ii), realizada a contaminação (diferentes níveis) das ostras, para que fossem submetidas aos testes de depuração, com diferentes tratamentos (7 dias). no capítulo i foram analisadas: ostras, água e sedimento marinhos dos locais, sendo que as amostras procedentes diretamente do laboratório fornecedor das ostras (laboratório de cultivo de moluscos marinhos/ufsc-lcmm) funcionaram como o tempo zero da contaminação (t0 dia). foram detectados: (1) bactérias: e. coli na água do mar (acima de 43 ufc/100 ml em tap e buc) e salmonella sp. nas ostras (em buc), por cultura bacteriana; (2) protozoários: cryptosporidium nas ostras (tap) e giardia na água do mar (buc), pela imunoseparação magnética e imunofluorescência tendo esta última sido sequenciada para a confirmação da espécie (g.duodenalis); (3) vírus entéricos: adenovírus humano/hadv (nos quatro locais), vírus da hepatite a nas ostras (buc), norovírus humano (nov) gi nas ostras (tap e buc) e gii na água do mar (buc), poliomavírus-jc nas ostras (lcmm), todos por (rt) qpcr. também se verificou a ausência de hadv infecciosos nas ostras, por teste de placa de lise. (4) pesticidas organoclorados; hidrocarbonetos alifáticos/has e policíclicos aromáticos/hpas; alquibenzenos lineares/labs foram detectados em vários locais, por cromatografia gasosa, nas ostras e sedimentos. no capítulo ii, somente ostras foram analisadas, antes e durante a depuração. foram utilizadas lâmpadas uv (18 e 36 w) na descontaminação das águas de depuração e comparadas as cinéticas de decaimento dos contaminantes nos tecidos das ostras. parte dos animais de cada local, foi artificialmente contaminada com hadv2 e norovírus murino/mnv-1, funcionando como controles positivos de contaminação viral durante as depurações. não houve eliminação dos hadv e protozoários das ostras durante a depuração. mnv-1 foi eliminado após quatro dias de depuração. também foram detectados has, hpas e labs, antes e após as depurações. concluídos os testes, depuradoras com uv 36 w foram disponibilizadas em quatro restaurantes em florianópolis e realizadas análises virais das ostras depuradas por quatro dias (43 amostras). somente hadv foi detectado (uma amostra) e não estava infeccioso. laudos das análises foram entregues aos comerciantes. as contaminações detectadas ameaçam a produção de ostras em florianópolis, sendo necessário o aumento na fiscalização nas regiões de cultivo. embora a depuração tenha removido o mnv-1 (vírus com genoma de rna, como a maioria dos vírus entéricos humanos veiculados pelas ostras), não eliminou outros patógenos e compostos orgânicos investigados. além dos ensaios descritos na tese, também foram realizadas outras pesquisas (apêndice a), referentes à bioacumulação diferencial das espécies de nov gi e sapovírus em ostras e inativação termal de rotavírus em mexilhões durante o cozimento. estas pesquisas adicionais foram realizadas durante estágio doutoral, 11 meses, no institut français de recherche pour l'exploitation de la mer (ifremer), na frança.