Sistema termodinâmico de monitoramento de fontes para determinação da taxa de biodegradação em áreas contaminadas por hidrocarbonetos de petróleo e método implementado por computador para tratamento de dados brutos monitorados. a presente invenção se refere a um sistema termodinâmico e a um método para quantificar a quantidade de metano oxidado e estimar a taxa de biodegradação dos hidrocarbonetos de petróleo na zona da fonte de contaminação em tempo real. a taxa de biodegradação é usada para estimar o tempo requerido para atingir níveis de segurança na concentração de contaminantes no solo. o sistema compreende um conjunto de transdutores de fluxo de calor distribuídos no solo, diferentes planos, um cilindro, uma estação com autonomia energética. o método compreende analisar os dados brutos, eliminar outliers causados por falhas eventuais nas sondas, calcular as temperaturas e seus gradientes para cada instante medido em cada ponto de observação, calcular os parâmetros do interpolante de temperatura para cada instante usando as temperaturas e derivadas pontais, calcular a energia interna do solo e os fluxos de calor para cada instante, calcular o valor acumulado de energia transmitida, usar um modelo matemático para ajustar os parâmetros da curva de decaimento e identificar se existe alguma dependência temporal nas taxas de decaimento.