O presente projeto foca em simulações usando di...o presente projeto foca em simulações usando dinâmica molecular (dm), em conjunto com cálculos de energia livre de ligação, para a obtenção da afinidade de diferentes ligantes a proteínas. tal estudo possui aplicação direta na indústria farmacêutica, já que tem o potencial de diminuir o tempo e os custos associados ao design de novos fármacos. há duas barreiras atualmente para tornar esse processo prático: o seu elevado custo computacional, e o grande número de passos necessários para a sua implementação, muitos deles tendo de ser feitos manualmente. visamos aqui superar esses dois obstáculos, aliando a alta performance dos atuais programas de simulação em placas de processamento gráfico, junto com uma automatização completa de todo o processo. o objetico principal portanto é o desenvolvimento de três programas na linguagem python: fetool.py, autopmf.py e ghdd.py. todos eles realizam cálculos de energia livre de ligação de maneira automatizada, diferindo principalmente no programa de simulação utilizado para cada um, e no sistema em que eles melhor se adequam. há a parceria de outros grupos nesse projeto, como o gilson lab na universidade da california san diego (ucsd), e o departamento de química da ufsc.