A tb ainda representa uma importante ameaça par...a tb ainda representa uma importante ameaça para a saúde pública, sendo uma das doenças infecciosas que mais causa mortes no mundo, principalmente nos países em desenvolvimento. no brasil, as capitais manaus (98,3/100 mil hab.), porto alegre (88,8/100 mil hab.), recife (78,3/100 mil hab.) e rio de janeiro (66,8/100 mil hab.) destacaram-se por apresentarem coeficiente de incidência que excederam o valor nacional (30,9/100 mil hab.) em mais de 100%. entre as capitais, o rio de janeiro apresenta o maior coeficiente de mortalidade do país de 7,0/100 mil hab. embora santa catarina tenha uma incidência baixa da tb, 23,1/100 mil hab., alguns municípios apresentam taxas superiores às do brasil. é o caso da capital do estado, florianópolis, que apresenta uma taxa de incidência de 50,1/100 mil hab e mortalidade de 1,3/100 mil hab. o estudo da epidemiologia molecular é uma importante ferramenta para o melhor entendimento da doença e sua transmissão, na investigação de surtos, na diferenciação entre recidiva ou reinfecção, na identificação dos clones de maior incidência, inclusive os clones de tb-mdr. o sequenciamento completo do genoma é capaz de fornecer uma visão rápida e abrangente do genótipo do organismo e, assim, permite uma previsão confiável do fenótipo de resistência aos fármacos. além disso, ele fornece uma maior resolução na identificação de cadeias de transmissão em potenciais cenários de surto. o presente projeto possibilitará o fortalecimento do grupo de pesquisa em tb da universidade federal de santa catarina e o estabelecimento de parcerias de pesquisa com grupos importantes do brasil (ufrj) e internacionais (swiss tropical and public health institute, university of basel, basiléia, suíça e o grupo americano do dr. marco schito thecrtitical path institute/arizona/eua). objetivo geral analisar a filogenia molecular com técnicas de alta resolução em isolados de m. tuberculosis circulantes na grande florianópolis. objetivos específicos - construir um banco de amostras clínicas baseado em coorte ambulatorial de indivíduos com recidiva ou reinfecção por tb após o desfecho do tratamento de 1ª linha; - genotipar os isolados de m. tuberculosis que compuseram a 1ª etapa do estudo e isolados de indivíduos com recidiva pela técnica miru-vntr; - genotipar os isolados de m. tuberculosis de indivíduos com recidiva pela técnica de spoligotyping; - construir um dendograma de similaridade da combinação dos métodos de spoligotyping e miru-vntr; - analisar a frequência dos tipos de isolados de m. tuberculosis circulantes na grande florianópolis; - sequenciar regiões parciais dos genes rpob, katg, inha, ahpc e identificar os pontos de mutações envolvidos com a resistência à rifampicina e isoniazida nas amostras de pacientes que obtiveram o desfecho clínico falência no tratamento de 1ª linha e óbito por tb e nos isolados resistentes aos antimicrobrianos; - sequenciar o genoma completo dos isolados de m. tuberculosis provenientes de pacientes que evoluíram para falência no tratamento de 1ª linha e óbito por tb, os resistentes aos antimicrobianos, os que apresentaram recidiva e os com suspeita de infecção mista no miru-vntr; - analisar os resultados obtidos com ferramentas de bioinformática - inicialmente investigando genes de virulência; - caracterizar os genes de resistência aos antimicrobianos; - relacionar as mutações encontradas com os perfis de spoligotyping e miru-vntr e o dados clínico-epidemiológicos dos indivíduos; - relacionar o desfecho clínico (cura, falência, recidiva ou óbito) com as variáveis epidemiológicas e moleculares