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Universidade Federal de Santa catarina (UFSC)
Programa de Pós-graduação em Engenharia, Gestão e Mídia do Conhecimento (PPGEGC)
Detalhes do Documento Analisado

Centro: Ciências da Saúde

Departamento: Análises Clínicas/ACL

Dimensão Institucional: Pesquisa

Dimensão ODS: Social

Tipo do Documento: Projeto de Pesquisa

Título: IDENTIFICAÇÃO E CARACTERIZAÇÃO DE MUTAÇÕES NO GENOMA DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS DE ISOLADOS RESISTENTES E SENSÍVEIS A FÁRMACOS DEPOSITADOS EM DADOS PÚBLICOS DE SEQUENCIAMENTO E NA VALIDAÇÃO EM ISOLADOS DE PACIENTES DE FLORIANÓPOLIS

Coordenador
  • MARIA LUIZA BAZZO
Participante
  • ANDRÉ NICOLAU AQUIME GONÇALVES
  • LUIS FELIPE NUNES
  • MARCOS ANDRÉ SCHÖRNER
  • MARIA LUIZA BAZZO (D)

Conteúdo

A tuberculose (tb) é uma doença infecciosa e tr...a tuberculose (tb) é uma doença infecciosa e transmissível causada pela bactéria mycobacterium tuberculosis, que afeta primordialmente os pulmões e em alguns casos mais graves, pode ser capaz de acometer outros órgãos e sistemas. a doença é caracterizada como problema de saúde pública, pois a cada ano são notificados cerca de 70 mil casos no brasil e 10,4 milhões de casos novos no mundo, sendo que 4,5 mil e 1,8 milhões evoluem a óbito, respectivamente. m. tuberculosis, teve o sequenciamento do genoma completo em 1998 e desde então vêm sendo descritos na literatura diversos fatores de resistências aos fármacos e virulência. nos últimos anos observou-se aumento de notificações de casos da doença, principalmente aquelas com isolados resistentes aos antimicrobianos. embora a terapias de primeira linha utilize combinações de fármacos (isoniazida, rifampicina, pirazinamida e estreptomicina), prevenção de resistências (etambutol) e de esterilização (rifampicina), continuam sendo observados casos de isolados bacterianos mono resistentes e resistentes a multidrogas (mdr). há diversos métodos fenotípicos e genotípicos para a identificação de fatores de resistência, porém a maioria dos métodos genotípicos requer conhecimento a priori das mutações envolvidas em resistência. por outro lado, com o advento de tecnologias de nova geração para o sequenciamento completo do genoma (wgs) das bactérias, tornou-se possível avaliar, de forma sistemática, as mutações em toda a extensão do genoma em isolados de m. tuberculosis. as descobertas de mutações em genes reconhecidamente envolvidos ou em genes não envolvidos com resistência aos fármacos abriram caminhos para uma maior compreensão desse fenômeno. nesse sentido, as mutações podem ser classificadas como, mutações conhecidas ou desconhecidas em genes de resistência, mutações conhecidas e não conhecidas em genes não envolvidos com resistência, e mutações em regiões gênicas sem função definida. na literatura, há diversas bibliotecas wgs de m. tuberculosis disponíveis para uso, apesar da grande quantidade de dados depositados, os estudos são focados em análises de mutações nos genes de resistência já descritos. portanto, o presente estudo visa realizar screening do genoma completo de isolados para grupos experimentais sensíveis e resistentes aos fármacos para o tratamento da tb. os dados de sequenciamento serão obtidos na base de dados sequence read archive (sra) do ncbi e serão submetidos em um workflow que será desenvolvido no laboratório de biologia molecular, microbiologia e sorologia (lbmms)/ccs/ufsc. a análise consistirá dos seguintes passos: obtenção dos dados em base de dados públicos, filtro pela qualidade das sequências, mapeamento no genoma de referência, anotação gênica automática, identificação de mutações e comparação com banco de dados de mutações de m. tuberculosis conhecidas. as perspectivas de resultados deste estudo são a descoberta, principalmente, de novas mutações em genes desconhecidos ou não anotados que não possuam evidência clara na resistência aos fármacos. adicionalmente, as mutações candidatas serão selecionadas baseadas em critérios como, família do isolado, tipo de resistência e/ou função dos genes para a validação em isolados obtidos pelo nosso grupo de estudo por meio de técnicas de biologia molecular.

Índice de Shannon: 3.6596

Índice de Gini: 0.888263

ODS 1 ODS 2 ODS 3 ODS 4 ODS 5 ODS 6 ODS 7 ODS 8 ODS 9 ODS 10 ODS 11 ODS 12 ODS 13 ODS 14 ODS 15 ODS 16
3,78% 4,68% 27,35% 4,82% 4,47% 4,17% 4,39% 5,51% 6,42% 4,16% 6,58% 4,45% 3,18% 4,90% 3,93% 7,20%
ODS Predominates
ODS 3
ODS 1

3,78%

ODS 2

4,68%

ODS 3

27,35%

ODS 4

4,82%

ODS 5

4,47%

ODS 6

4,17%

ODS 7

4,39%

ODS 8

5,51%

ODS 9

6,42%

ODS 10

4,16%

ODS 11

6,58%

ODS 12

4,45%

ODS 13

3,18%

ODS 14

4,90%

ODS 15

3,93%

ODS 16

7,20%