A produção de alimentos seguros e de qualidade é essencial para a indústria de alimentos e a população. a polpa de tomate é um alimento muito consumido no brasil e no mundo. o objetivo desse trabalho foi propor um modelo matemático e a solução numérica do tratamento térmico da polpa de tomate em um aquecedor micro-ondas, simulando a degradação do licopeno e a inativação de fungos termorresistentes durante o processo. a modelagem consistiu no acoplamento do fenômeno do eletromagnetismo, descrito pelas equações de maxwell, da transferência de quantidade de movimento, descrita pela equação de navier stokes e pela lei da continuidade, e da transferência de calor, descrita pelo balanço de energia. após a modelagem do aquecimento, foi modelada a inativação térmica dos esporos b. coagullans descrito pelo modelo de weibull e a degradação do licopeno pela equação cinética de primeira ordem. para a solução numérica, foi definida a malha nos domínios de cálculos (guia de onda, cavidade e tubo de aquecimento), assumiu-se para a polpa de tomate as propriedades físicas constantes e as propriedades dielétricas em função da temperatura. foram modelados dois sistemas diferentes, o primeiro considerando a mudança de fase (1) e o segundo não considerando a mudança de fase (2). a energia útil dissipada na polpa de tomate foi diferente para as diferentes geometrias tanto no sistema 1 quanto no sistema 2. esse aproveitamento enérgico para o tubo de 24 mm de diâmetro foi de 64 %, para o diâmetro de 31,8 mm foi de 76,3 % e para o diâmetro de 39,6 mm foi de 94,6 %. a energia requerida pelo magnetron para realização dos processos foi maior para o sistema 1 quando comparado com sistema 2. a amplitude de temperatura no fluido variou em função da vazão, da potência e do diâmetro para os dois sistemas. para o sistema 2, o aumento do diâmetro, da vazão e da potência gerou um aumento da amplitude de temperatura. para o sistema 1, o aumento do diâmetro e da potência diminuiu a amplitude de temperatura. observou-se que para os dois sistemas o comprimento de homogeneização variou em função da amplitude de temperatura do fluido. no sistema 1, para o mesmo diâmetro (24 mm e 31,8 mm), temperatura média fina de 95 °c e aumentando-se a vazão, o comprimento de homogeneização passou de 0,37 m para 0,50 m (35,13 % maior) e de 0,61 m para 0,83 m (36,06 % maior) respectivamente. para o diâmetro de 39,6 mm o comportamento foi inverso onde o comprimento de homogeneização passou de 1,12 m para 0,58 m, 93,1 % menor. no sistema 2, observou-se o aumento com comprimento de homogeneização com aumento da vazão para os três diâmetros estudados. mais duas simulações realizadas com polpa de tomate em maior concentração de sólidos solúveis, 23 °brix e 29 °brix, mostrou a influência da viscosidade e concentração de sólidos solúveis no comprimento de homogeneização, passando de 0,84 m (7 °brix) para 1,56 m (29 °brix). na saída do tubo aquecedor a amplitude de concentração de b. coagullans foi maior para o sistema 2 devido aos elevados “hot spots”, variando de 3 até -21,5 log ufc ml -1 no sistema 1 e 3 até 2,29 log ufc ml -1. o comprimento do tubo de retenção para seis reduções decimais na concentração de esporos no geral foi maior para o sistema 2. a degradação do licopeno foi inferior a 2 % em todos os processos exceto para vazão de 0,1 l min-1 no diâmetro de 39,6 mm e na temperatura de 95 °c para o sistema 1, onde a degradação chegou a 4,52 %. a comparação dos resultados desse trabalho com a literatura mostrou que o modelo proposto foi capaz reproduzir o tratamento térmico da polpa de tomate por micro-ondas. a homogeneização de fluidos viscosos, como o molho de tomate, pode ser alcançada utilizando tubos helicoidais, o que está de acordo com a literatura. outro resultado importante e também validado pela literatura foi a influência do diâmetro do tubo, da vazão e da potência aplicada na distribuição do campo elétrico, da energia dissipada e no perfil de temperatura da polpa de tomate.