O camarão branco do pacífico, litopenaeus vannamei, tem grande importância econômica por ser a espécie de crustáceo mais utilizada na carcinicultura em nível mundial. as maiores perdas para esse setor da aquicultura estão relacionadas à incidência de doenças nos cultivos, em particular, aquelas de etiologia viral, como a síndrome da mancha branca (causada pelo vírus da síndrome da mancha branca; white spot syndrome virus, wssv), e, ainda, pelas vibrioses, causadas por diversas espécies do gênero vibrio. os trabalhos que utilizam metodologias com abordagem in silico, apesar destas serem cada vez mais utilizadas, ainda podem ser considerados como exceção nas áreas das ciências biológicas. a proposta do presente trabalho foi montar (montagem de novo) um transcriptoma de qualidade de l. vannamei, a partir de dados públicos, e utilizá-lo em diferentes aplicações dentro da biologia computacional. o transcriptoma da montagem de novo obtido apresentou métricas de qualidade superiores em comparação àquelas descritas até o momento. a partir desta montagem de novo, foi possível executar todas as aplicações propostas, sendo que, entre as propostas, a única que apresentou mais limitações foi aquela voltada para a análise de transcrição diferencial. as análises filogenéticas e estruturais, aplicadas à família das histonas, resultaram em uma árvore filogenética global de histonas core, a qual não tinha sido construída até a conclusão do presente trabalho. ademais, foi possível obter diversas estruturas em 3-d de peptídeos antimicrobianos potenciais, derivados de h2a. as aplicações apresentadas, realizadas com base nos dados gerados no presente trabalho, asseguram a qualidade da montagem de novo do transcriptoma de l. vannamei obtida, e reforçam a relevância da integração e da contribuição da bioinformática nas diversas áreas de investigação das ciências biológicas.