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Universidade Federal de Santa catarina (UFSC)
Programa de Pós-graduação em Engenharia, Gestão e Mídia do Conhecimento (PPGEGC)
Detalhes do Documento Analisado

Centro: Ciências da Saúde

Departamento: Não Informado

Dimensão Institucional: Pós-Graduação

Dimensão ODS: Social

Tipo do Documento: Tese

Título: EPIDEMIOLOGIA MOLECULAR E AVALIAÇÃO DE TESTES LABORATORIAIS PARA DIAGNÓSTICO DA TUBERCULOSE EM AMOSTRAS CLÍNICAS DO HOSPITAL UNIVERSITÁRIO POLYDORO ERNANI DE SÃO THIAGO – HU/UFSC E DESENVOLVIMENTO E OTIMIZAÇÃO DE UM TESTE DE PCR QUANTITATIVO PARA DETECÇÃO DE MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS

Orientador
  • MARIA LUIZA BAZZO
Aluno
  • RODRIGO IVAN PRIM

Conteúdo

A tuberculose (tb) é uma doença infectocontagiosa causada por bactérias do complexo mycobacterium tuberculosis. a cultura é o método padrão-ouro no diagnóstico laboratorial de tb, mas o resultado é obtido em até oito semanas em meio de cultura sólido e em até seis semanas em meio de cultura líquido. a baciloscopia apresenta resultado rápido, porém sua sensibilidade é baixa, especialmente na tb extrapulmonar. uma boa alternativa é a utilização de testes moleculares, como por exemplo, o teste xpert® mtb/rif. além disso, é importante o desenvolvimento de metodologias in house, que tornam o custo mais acessível. este trabalho foi dividido em três capítulos experimentais (ce), sendo o ce-i um estudo descritivo retrospectivo para avaliação do teste xpert® mtb/rif em amostras de rotina do hospital universitário da ufsc, o ce-ii um estudo descritivo prospectivo analisando os dados clínicos e epidemiológicos dos participantes, bem como a avaliação do teste xpert® mtb/rif em reação à cultura sólida e líquida e aplicação de metodologias de epidemiologia molecular diretamente de restos de reação do teste xpert® mtb/rif e o ce-iii o desenvolvimento e a otimização de uma qpcr para diagnóstico da tb utilizando sondas de hidrólise. na cultura líquida e na cultura sólida houve o crescimento de 17/19 e 18/19 amostras pulmonares e 3/4 e 4/4 amostras extrapulmonares de pacientes com tb. a tosse por mais de duas semanas, a perda de peso, a sudorese noturna e o contato prévio com pessoas com tb foram significativamente mais presentes em participantes com tb pulmonar (cultura positiva) do que em participantes sem tb pulmonar (cultura negativa). a sensibilidade da baciloscopia nas amostras pulmonares variou entre 70 e 80%, exceto para os participantes com tb prévia, onde foi obtido 100% se sensibilidade. em amostras extrapulmonares a sensibilidade da baciloscopia foi baixa. já o teste xpert® mtb/rif teve sensibilidade e especificidade acima de 95% em amostras pulmonares. apesar da alta especificidade, a sensibilidade em amostras extrapulmonares do teste xpert® mtb/rif ficou próxima a 40%. foi possível obter os perfis do miru-15 a partir do dna genômico presente nos restos de reação em amostras que amplificaram no xpert® mtb/rif com cq menor ou igual a 24, mas os perfis do spoligotyping foram obtidos com sucesso somente a partir do isolado clínico. a qpcr in house desenvolvido apresentou ótima performance analítica, especialmente nos limites de detecção, que foram de 4,7 cópias, 11,8 cópias e 23,6 cópias por reação, respectivamente para os alvos is6110, is1081 e senx3.

Índice de Shannon: 3.91072

Índice de Gini: 0.928489

ODS 1 ODS 2 ODS 3 ODS 4 ODS 5 ODS 6 ODS 7 ODS 8 ODS 9 ODS 10 ODS 11 ODS 12 ODS 13 ODS 14 ODS 15 ODS 16
4,29% 5,28% 13,64% 8,55% 5,17% 4,51% 5,29% 6,25% 8,25% 5,21% 8,14% 5,19% 3,91% 5,08% 4,44% 6,80%
ODS Predominates
ODS 3
ODS 1

4,29%

ODS 2

5,28%

ODS 3

13,64%

ODS 4

8,55%

ODS 5

5,17%

ODS 6

4,51%

ODS 7

5,29%

ODS 8

6,25%

ODS 9

8,25%

ODS 10

5,21%

ODS 11

8,14%

ODS 12

5,19%

ODS 13

3,91%

ODS 14

5,08%

ODS 15

4,44%

ODS 16

6,80%