O objetivo do presente trabalho é descrever e analisar a gestão do processo de esterilização de artigos médico-hospitalares na atenção primária. o estudo é do tipo transversal e descritivo, com abordagens quantitativa e qualitativa. a etapa quantitativa foi realizada nos 49 centros de saúde de florianópolis, a capital do estado de santa catarina. os sujeitos da pesquisa foram os centros de saúde, representados pelos profissionais de saúde responsáveis pela gestão do processo de esterilização. nesta etapa, foi apresentado um questionário com 45 perguntas baseadas nas melhores práticas publicadas na resolução da diretoria colegiada nº 15, de 15 de março de 2012, da agência nacional de vigilância sanitária - anvisa. foi utilizado uma abordagem de data discovery para análise dos dados. com relação ao número teórico de acertos do questionário, foram eleitos para a etapa qualitativa da pesquisa os três centros de saúde com o maior número de respostas corretas, e os três centros de saúde com o menor número de respostas corretas. a etapa qualitativa consistiu na realização de entrevista com cada responsável. as entrevistas foram codificadas e classificadas em categorias, as quais foram analisadas. como resultado, foi possível ratificar os dados apontados pela etapa quantitativa: os centros de saúde realizam diversos processos em desacordo com as melhores práticas publicadas pela anvisa. as equipes não possuem procedimento operacional padrão para realização do processo de esterilização, faltam equipamentos de proteção individual e coletivos, ou, quando existem, não são utilizados, praticamente não há treinamento na área e o espaço físico para armazenagem dos materiais esterilizados não é de acesso restrito, dentre outras inconformidades. os indicadores obtidos pela aplicação dos questionários mostram um panorama geral da situação do processo de esterilização nos centros de saúde de florianópolis, e poderiam ser utilizados na elaboração do plano municipal de saúde para os próximos anos. é possível inferir que este cenário aponta que outros níveis de atenção à saúde, como policlínicas e hospitais, possam possuir problemas semelhantes, demonstrando que ainda existem lacunas de conhecimento a serem exploradas.