Este estudo teve como objetivo analisar os fatores determinantes da eficiência dos gastos públicos em universidades federais brasileiras para o período de 2013 a 2017. o universo da pesquisa é composto por 59 universidades federais. para atender ao objetivo da pesquisa, o método aplicado foi dividido em dois estágios. para o primeiro estágio foi aplicado ferramenta de análise envoltória de dados (dea) para mensurar a eficiência. no segundo estágio aplicou-se um modelo de regressão truncada, um procedimento de duplo-bootstrap para correção de viés e teste da significância estatística das variáveis da pesquisa. os resultados demonstram que existem um número relativamente pequeno de universidades federais eficientes, e as universidades federais que foram eficientes nos cinco períodos de análise foram unifap, ufam e ufpa. considerando o modelo de regressão truncada de simar e wilson (2007), as variáveis significativas na eficiência dos gastos públicos em universidades federais foram o gasto público em educação superior, o número de professores, número de matrículas, número de concluintes, gastos totais com funcionários e número total de funcionários. diante disso, pode-se afirmar que estas variáveis são determinantes na eficiência pública nas universidades federais analisadas. por fim, os achados da pesquisa demonstram que as universidades federais ainda são ineficientes quanto a alocação dos gastos públicos, dessa forma, destaca-se a importância e a necessidade por parte dos gestores de uma boa gestão dos recursos públicos disponibilizados às universidades federais.