A lei federal 9605/1998 (lei dos crimes ambientais) possui diversos artigos que se referem a crimes contra a flora. na esfera federal a apuração criminal é executada pelo departamento de polícia federal. indispensável é a elaboração de exame pericial nos crimes que deixam vestígios, como a maioria dos delitos ambientais, inclusive aqueles contra a flora. o relativo desenvolvimento das áreas de fiscalização ambiental relacionadas aos órgãos ambientais governamentais tem consolidado uma série de técnicas e novas metodologias para detecção e caracterização de danos ao meio ambiente, entretanto, quando se sai da área administrativa e se entra na criminal, o enfoque é distinto. a preocupação com a materialidade, com as datas dos supostos delitos, com a autoria e demais circunstâncias e agravantes relacionadas ao crime adquirem grande importância. após um diagnóstico do que já foi feito em matéria de perícia criminal de flora no estado entre os anos de 2008 e 2012, onde se obteve expressivos números relacionados a impactos sobre a flora catarinense, representados em uma área total de 821,4 ha no contexto das diferentes regiões fitoecológicas, com destaque para a restinga e o mangue (448,3 e 21,7 ha desflorestados respectivamente), o presente trabalho procura abordar aspectos metodológicos das perícias, fornecendo subsídios práticos e teóricos, além de desafios e perspectivas para a execução dessa atividade no estado de santa catarina, justamente onde a experiência do autor é mais aprofundada. diversos casos de repercussão podem ser citados que se relacionam diretamente ou indiretamente ao tema, entre eles a operação moeda verde e dríade da lavra da polícia federal e demais instituições envolvidas na persecução penal. as perícias de crimes contra a flora foram fator definitivo para a apuração criminal.