A comunidade zooplanctônica foi examinada pela primeira vez durante 12 meses na lagoa do peri – florianópolis/sc, lagoa costeira subtropical. o objetivo foi descrever a composição, a distribuição espaço-temporal e a dinâmica da comunidade zooplanctônica, em um ambiente dominado por cianobactérias, especificamente a espécie cylindrospermopsis raciborskii, limitado por nutrientes e a relação desta comunidade com os principais parâmetros de trofia da água. mensalmente foram amostradas quatro regiões no período de abril de 2011 a março de 2012. medidas das principais variáveis físicas e químicas da água foram realizadas in situ e em laboratório foi determinada a concentração de clorofila a. para as amostras de zooplâncton foram coletados 50 l de água e filtrados em uma rede de plâncton com 50 μm de abertura de malha. a comunidade zooplanctônica foi composta por alta densidade de rotíferos, cladóceros de pequeno porte e copépodos ciclopóides. a riqueza da comunidade foi de 16 táxons sendo os rotíferos dominaram em todos os pontos de amostragem e praticamente em todos os períodos do ano em riqueza de espécies e densidade. a comunidade mostrou homogeneidade espacial, porém com variabilidade temporal. a presença e dominância de cianobactérias filamentosas é o principal fator que tem regulado a comunidade, tornando-a dominada por rotíferos, característica de ambiente eutrofizado. a temperatura da água foi o fator abiótico que mais contribuiu para a variação da comunidade ao longo do tempo, com uma variação de 14 °c no inverno de 2011 e 29 °c no verão de 2012. a concentração de clorofila a aumentou significativamente durante o período de estudo com valor mínimo no mês de maio de 2011 (16,55 μg.l-1) e máximo no mês de março de 2012. (59,81 μg.l-1). a modificação dos valores de clorofila a e da composição do zooplâncton, com presença de espécies indicadoras de eutrofização como brachionus calyciflorus, brachionus angularis e asplanchna sp, podem confirmar que a água da lagoa peri está passando um processo negativo que pode causar um aumento do estado trófico, causando grande impacto na qualidade da água e alterando a comunidade biológica.