O jundiá rhamdia quelen é uma espécie nativa importante na pesca e aquicultura na região sul. a pesca é comprometida pela degradação dos ambientes aquáticos naturais, e no cultivo as perdas são frequentemente relacionadas a enfermidades, sendo fundamental estabelecer ferramentas de diagnóstico para implantar medidas adequadas. durante dois anos, este estudo analisou a hematologia e histologia de jundiás do rio da madre, paulo lopes, sc, em um ponto que recebe efluentes de rizicultura e outro à montante. os pontos apresentaram em média 3,40 e 1,31?g.l-1 do herbicida clomazone, respectivamente. peixes de ambos os locais apresentaram alterações histológicas nas brânquias e no fígado e aumento de monócitos no sangue em peixes do ponto mais contaminado. também utilizou-se parâmetros hematológicos e parasitológicos como indicadores de saúde para o jundiá cultivado no município de paulo lopes, onde 137 peixes foram coletados e seus parâmetros hematológicos e parasitológicos relacionados aos parâmetros de qualidade da água, de acordo com a época do ano. na estação quente obersevou-se aumento na intensidade de parasitismo, e nos números totais de leucócitos, trombócitos e linfócitos, e redução de monócitos. a hematologia, a histopatologia e a parasitologia mostram-se ferramentas eficazes de diagnóstico na piscicultura e em ambiente natural.