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Universidade Federal de Santa catarina (UFSC)
Programa de Pós-graduação em Engenharia, Gestão e Mídia do Conhecimento (PPGEGC)
Detalhes do Documento Analisado

Centro: Ciências Biológicas

Programa de Pós-Graduação: Programa de Pós-Graduação em Biologia Celular e do Desenvolvimento

Dimensão Institucional: Pós-Graduação

Dimensão ODS: Social

Tipo do Documento: Dissertação

Título: ELABORAÇÃO DE UM PAINEL DE MARCADORES DE ANCESTRALIDADE PARA ESTUDOS CASO-CONTROLE E ORGANIZAÇÃO DAS INFORMAÇÕES EM BANCO DE DADOS LOCAL

Orientador
  • ILIADA RAINHA DE SOUZA
Aluno
  • GUILHERME DEBORTOLI

Conteúdo

Debortoli, g. elaboração de um painel de marcadores de ancestralidade para estudos caso-controle e organização das informações em banco de dados local. 2013. 112p. dissertação de mestrado – universidade federal de santa catarina, florianópolis, sc. a população brasileira é produto da miscigenação entre três principais grupos étnicos: ameríndios (que já habitavam estas terras à época do descobrimento), europeus (principalmente portugueses) e africanos (trazidos de forma forçada como mão de obra escrava). estimar as diferentes proporções de ancestralidade em populações miscigenadas é de extrema importância para estudos genéticos que buscam encontrar alelos de sucetibilidade a doenças, uma vez que a não correção da estratificação populacional pode ocasionar desvios levando a associações espúrias. para o controle da estratificação populacional, a utilização de marcadores informativos de ancestralidade tem sido amplamente utilizada por apresentar um alto diferencial de frequência entre populações de regiões geograficamente distintas. o objetivo deste estudo foi genotipar quatro marcadores informativos de ancestralidade adequados para amostras da população brasileira visando estender esta abordagem para entender a estruturação populacional em estudos de caso-controle, utilizando como modelo a doença psoríase. adicional ao principal objetivo, um banco de dados biológico (bdb) foi diagramado e implementado, para auxiliar na organização e armazenamento de informações a respeito das amostras aqui utilizadas. as frequências dos quatro marcadores (at3, sb19.3, apo e pv92) foram estimadas em amostras de pacientes (psr) diagnosticados com psoríase (n=100) e controles saudáveis (psc) sem histórico de doença (n=100, psc) coletadas na cidade de florianópolis - sc. os perfis genéticos foram obtidos através de pcr convencional e eletroforese em gel de agarose. as análises estatísticas empregaram programas tais como genepop, gda e admix 3. o bdb proposto foi desenvolvido e estruturado em sistema de gestão de bases de dados relacionais mysql, e a interface gráfica foi desenvolvida em linguagem php e html. por meio de análises moleculares e estatísticas, os resultados obtidos evidenciaram que os dois grupos de indivíduos aqui estudados (psr e psc) apresentaram semelhanças quanto a sua ancestralidade genética, não sendo observado grandes diferenças populacionais. as estimativas de mistura revelaram que as duas populações analisadas são tri-híbridas, com alta preponderância do componente europeu, seguido de africano e ameríndio respectivamente. apesar dos poucos marcadores utilizados foi possível discriminar a contribuição genética dos grupos ancestrais indicando que mesmo um número reduzido de marcadores pode ser suficiente, desde que apropriadamente selecionados, para responder uma pergunta específica. o bdb construído e diagramado neste trabalho recebeu o nome de lapogedb (lapoge database - www.lapoge.sites.ufsc) e, mostrou-se uma ferramenta eficaz para o armazenamento estruturado de informações que variam entre dados epidemiológicos e genéticos referentes a amostras utilizadas ao longo de 19 anos de funcionamento do laboratório de polimorfismos genéticos da universidade federal de santa catarina (lapoge-ufsc).

Pós-processamento: Índice de Shannon: 3.81302

ODS 1 ODS 2 ODS 3 ODS 4 ODS 5 ODS 6 ODS 7 ODS 8 ODS 9 ODS 10 ODS 11 ODS 12 ODS 13 ODS 14 ODS 15 ODS 16
4,47% 4,78% 18,08% 4,08% 3,56% 5,09% 3,78% 5,51% 5,19% 4,71% 10,60% 5,32% 3,06% 5,67% 9,10% 7,00%
ODS Predominates
ODS 3
ODS 1

4,47%

ODS 2

4,78%

ODS 3

18,08%

ODS 4

4,08%

ODS 5

3,56%

ODS 6

5,09%

ODS 7

3,78%

ODS 8

5,51%

ODS 9

5,19%

ODS 10

4,71%

ODS 11

10,60%

ODS 12

5,32%

ODS 13

3,06%

ODS 14

5,67%

ODS 15

9,10%

ODS 16

7,00%