Pacientes imunodeprimidos podem apresentar infecções virais com evolução rápida, sintomatologias atípicas graves e muitas vezes fatais, sendo fundamental um diagnóstico precoce para estabelecimento do tratamento efetivo, redução da toxicidade e da resistência aos antivirais. hsv-1, hsv-2 e poliomavírus bk são vírus de importância clínica para imunodeprimidos e podem levar a rejeição de órgãos em transplantados. assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver um sistema celular repórter, utilizando a proteína fluorescente gfp, para hsv-1 e 2 e implantar uma qpcr utilizando amostras clínicas de pacientes transplantados renais para detecção de poliomavírus bk. o sistema celular repórter foi construído através da transfecção de células vero com o vetor pzsgreen1-1 ligado ao promotor icp10 (f3r3 e f4r3) da rr1 do hsv-2. a regulação da expressão da gfp via icp10 é dependente da infecção viral e acontece por meio da proteína viral transativadora vp16 e de fatores celulares oct-1 e hcf-1. a efetividade do sistema foi avaliada por infecção viral e pela aplicação de antivirais (aciclovir, ácido gálico, convalotoxina e extrato de uncaria sp.) e candidatos antivirais inativos (extrato de passiflora edulis e derivados de cardenolídeos). o sistema repórter f4r3 zsgreen1-1 expressou gfp em função da infecção por hsv-1 e 2, a qual foi detectada por microscopia de fluorescência e/ou citometria de fluxo. em análise por citometria de fluxo, a fluorescência do sistema repórter correlacionou-se diretamente com os títulos virais (moi de 4,0 x10-3 a 3,3 x10-4, ou seja, 1 partícula viral a cada 250 a 3000 células), o sistema manteve a capacidade de expressão da gfp na presença de agentes sem propriedade antiviral e não expressou fluorescência quando tratado com antivirais. o sistema f4r3 zsgreen1-1 mostrou-se um sistema funcional com possíveis aplicações para diagnóstico clínico, para elaboração de testes de resistência aos antivirais e para a pesquisa de novos medicamentos. a qpcr para poliomavírus bk foi implantada utilizando amostras de dna cedidas pelo hemosc com iniciadores dirigidos para o antígeno t viral. o limite de detecção foi de 18 cópias genômicas/ reação com quantificações variando entre 9,8 x 105 a 6,7 x 107 cópias genômicas/ ml. a qpcr foi efetiva para análises de amostras clínicas e apresentou limite de detecção suficiente para avaliação de risco de nefropatia em transplantados renais.