A avaliação dos livros didáticos de ciências para os anos finais do ensino fundamental, realizada pelo programa nacional do livro didático (pnld), referente à fragmentação dos conteúdos de ciências, constituiu o objeto de estudo deste trabalho. a partir da análise de documentos oficiais norteadores do ensino de ciências, dos guias de livros didáticos de ciências publicados pelo mec e de duas coleções de livros didáticos aprovadas pelo pnld, investigou-se a organização dos conteúdos nos livros didáticos de ciências nas coleções aprovadas pelo pnld. como parte da investigação, verificaram-se também as coleções de livros didáticos, mais escolhidas pelos professores de florianópolis no pnld 2008 e 2011. destas análises foi possível observar que, apesar dos documentos oficiais apontarem um ensino de ciências que articule os conhecimentos das diferentes áreas da ciência que o compõem, o pnld segue aprovando, em sua maioria, coleções que apresentam o ensino de ciências de modo fragmentado, imitando, dessa maneira, as opções para escolha dos professores de modo a abranger as diferentes realidades educacionais brasileiras. na pesquisa, observou-se também que as coleções de livros didáticos de ciências mais frequentemente escolhidas pelos professores na rede pública de ensino de florianópolis são coleções com conteúdos fragmentados. os resultados obtidos indicam a necessidade de verificar os critérios e as abordagens do pnld, para que os avanços identificados nas pesquisas e nos documentos oficiais, referentes ao ensino de ciências, sejam incorporados na produção dos livros didáticos. considera-se também a necessidade da inserção da questão do livro didático de maneira mais enfática na formação inicial e continuada de professores de ciências.